Został utworzony z dniem 1 maja 2003r. na mocy Uchwały nr V/31/2003 Rady Miejskiej w Gubinie z dnia 27 lutego 2003r. jako zakład budżetowy Gminy Gubin o statusie miejskim. Podstawę prawną działania zakładu stanowi jego statut.

Głównym zadaniem, które postawiono przed zakładem było wynajmowanie lokali mieszkalnych i użytkowych wchodzących w skład mieszkaniowego zasobu gminy. Do 30 kwietnia 2003r. zajmował się tym Zakład Gospodarki Mieszkaniowej przy PUM Sp. z o. o. w Gubinie. Dodatkowo MZUK-owi powierzone zostało zarządzanie i utrzymywanie cmentarza komunalnego w Gubinie, które do tej pory było wykonywane przez firmę prywatną. Uchwałą nr XII/98/2003 Rady Miejskiej w Gubinie z dnia 27 listopada 2003r. rozszerzono zakres działalności zakładu o świadczenie usług w zakresie robót budowlanych i remontowych na rzecz Gminy Gubin o statusie miejskim polegające głównie na bieżącym utrzymywaniu i budowie miejskich dróg i chodników. W 2010 roku w wyniku zmian w obowiązujących przepisach MZUK musiał zrezygnować z zarządzania cmentarzem komunalnym a w to miejsce zakład został zarządcą targowisk miejskich w Gubinie (targowisko spożywcze – Obrońców Pokoju i targowisko przemysłowe – ul. Śląska). W efekcie utworzenia Referatu Drogowego Urzędu Miejskiego w Gubinie w lutym 2020 roku Zakład zaprzestał utrzymywania dróg miejskich.